Hipnoz seansları sayesinde çocukken kız kardeşi Samantha’nın bazı bilinmeyen güçler tarafından kaçırıldığına ikna olan Mulder,X-Dosyalarının (Sıradışı,açıklanamayan ve doğaüstü davaların mahzeni) arkasında saklanan gerçekleri bulmayı bir saplantı haline getirdi. Mulder’ın X-Files bölümünde çalışmayı seçmesi tamamen kendi tercihi olmayabilir. Sigara İçen Adam,Sendikanın örtbasçısı olarak,ajanı rahatça kontrol edilebileceği bir yere yerleştirdiklerinden bahseder. Sendika Mulder’ı asla öldürmedi,çünkü onların yayılmasına ihtiyaç duydukları yalanları Mulder onlar için yaymakta çok başarılıydı.

Mulder’ın işkolik hayatı onu ailesinden çalmıştı,ki ailesi de bizzat onun aydınlatmaya çalıştığı gizli öğeler tarafından yok edilmişti. “Closure”da nihayet kız kardeşi hakkındaki gerçeği bulur ve Samantha’nın kaçırıldıktan ve üstünde deneyler yapıldıktan sonra onu kurtarmak için ruhani bir müdahale gerçekleştiğini ve ruhunun Cennete yollandığını öğrenir. Zihnini meşgul eden bu olayın son bulmasıyla Mulder şimdi daha büyük bir gerçeğe odaklanmıştır: Uzaylı hayatın varlığının onaylanması. Ancak ne yazık ki kendisi bir X-Dosyası olmuştur ve onu kurtarma görevi Mulder’ın hayatında güvendiği tek kişiye düşmüştür-ortağı Scully...